你们的沟通方式有问题，如果无法达成一致意见你们就讨论清楚到底在南京好还是在北京好。
讨论的过程中出现争执也很正常，但是你要保持一个平和的心态把利弊都分析清楚。
既然考虑到是女方主观意愿，更加应该让她把这个说出来然后解决一下问题。
妻子怀孕抛下一个人走是肯定不行的，还有她居然还用回了南京不工作来威胁，我觉的应该好好的讨论一下，两个人一起过可不是单单只为了达到自己的目的，都推脱这么多次了，还是把这个讲清楚吧，讲的时候一定要心平气和的同时表达自己强烈的决心，同时提出合理怀疑。

其实问题出现在更加前面，结婚的时候就该讨论好这个问题，为什么要待一年，去了南京也是一起生活为什么不愿意去，这些你现在都是不清楚。

可是你万万不能因为现在的无法忍受和一再欺骗而抛下她一个人离开，这样会伤害所两个家庭的所有人包括你自己。

我非常建议楼主进行深入的讨论，如果她耍脾气不讲道理不配合不支持你就可以用离婚来威胁她了。（这里我只是开玩笑的，我只是觉得对付她那样的女生这是一种可行的办法）

终究还是要过下去的，至于外遇啥的小心求证为妙，在一切不开朗之前使用最保守的手段来解决问题。

PS:离家远近个人认为不是问题，我认为是南京她没有归属感。

PPS:你和她的父母沟通过吗，可以用北京的生活很差而南京的条件很好来让岳父岳母对她施压嘛，如果岳父岳母不认为回南京好的话，就让你的爸妈给她施压嘛。

PPPS:我其实很喜欢那个外遇阴谋论哈哈哈