Protospacer

释义 Definition

protospacer（原间隔序列/原靶序列）：在细菌或古菌的 CRISPR-Cas 免疫系统中，指位于外源 DNA（如噬菌体或质粒）上的一段短序列；它与 CRISPR 阵列中的 spacer（间隔序列） 相对应，是被识别与切割的“目标原型序列”。（常与 PAM 邻近序列一起被 Cas 蛋白识别。）

发音 Pronunciation (IPA)

/ˈproʊtoʊˌspeɪsər/

例句 Examples

The Cas9 enzyme cuts DNA next to the protospacer.
Cas9 酶会在原靶序列（protospacer）旁边切割 DNA。

To avoid self-targeting, many CRISPR systems require a PAM adjacent to the protospacer, distinguishing foreign DNA from the organism’s own CRISPR array.
为避免“自我攻击”，许多 CRISPR 系统需要原靶序列旁边存在 PAM，从而把外源 DNA 与自身的 CRISPR 阵列区分开来。

词源 Etymology

该词由 proto-（“原始的/原型的”，源自希腊语 prōtos “第一”）+ spacer（“间隔物/间隔序列”）构成，字面含义可理解为“间隔序列的原型/对应目标”。在 CRISPR 语境里，它指 spacer 在外源基因组中“对应的那段序列”。

相关词 Related Words

• Spacer
• Crispr
• Cas9
• Pam
• Guide Rna
• Endonuclease
• Phage
• Plasmid

文学与著作 Literary Works

• Jennifer A. Doudna & Emmanuelle Charpentier (2014), Science：综述 CRISPR-Cas9 机制时常讨论 protospacer 与 PAM 的关系。
• Martin Jinek et al. (2012), Science：阐明 Cas9 在靶 DNA（protospacer）处的切割原理。
• Le Cong et al. (2013), Science：在人类细胞基因编辑语境中使用 protospacer 来指代靶向序列。
• Prashant Mali et al. (2013), Science：描述设计靶向序列（protospacer/target sequence）以实现基因组编辑。